wadi package

Submodules

• wadi.api_utils module
  • translate_strings()
  • get_pubchem_json()
  • query_pubchem_fuzzy()
  • query_pubchem_synonyms()
  • query_pubchem_cas()
  • get_pubchem_molecular_weight()
  • get_pubchem_properties()
• wadi.base module
  • WadiBaseClass
    • WadiBaseClass.__init__()
    • WadiBaseClass._execute()
    • WadiBaseClass._log()
    • WadiBaseClass._msg()
    • WadiBaseClass._warn()
    • WadiBaseClass.update_log_file()
    • WadiBaseClass._remove_log_file()
• wadi.dataobject module
  • DataObject
    • DataObject.__init__()
    • DataObject._execute()
    • DataObject.get_converted_dataframe()
    • DataObject.get_imported_dataframe()
    • DataObject.get_imported_names()
• wadi.filereader module
  • FileReader
    • FileReader.__call__()
    • FileReader._execute()
    • FileReader._read_file()
    • FileReader._read_single_row_as_list()
• wadi.harmonizer module
  • Harmonizer
    • Harmonizer.__init__()
    • Harmonizer.__call__()
    • Harmonizer._convert_values()
    • Harmonizer._execute()
• wadi.infotable module
  • InfoTable
    • InfoTable.__init__()
    • InfoTable.list_dict1_item()
    • InfoTable.list_keys()
    • InfoTable.update_items()
• wadi.mapper module
  • MapperDict
    • MapperDict.from_file()
    • MapperDict.default_dict()
    • MapperDict._create_hgc_units_dict()
    • MapperDict.pubchem_cas_dict()
    • MapperDict.pubchem_cid_dict()
    • MapperDict.translation_dict()
    • MapperDict.to_file()
    • MapperDict.translate_keys()
  • Mapper
    • Mapper.__init__()
    • Mapper.__call__()
    • Mapper._df2excel()
    • Mapper._match_exact()
    • Mapper._match_regex()
    • Mapper._match_fuzzy()
    • Mapper._match_pubchem()
    • Mapper._execute()
    • Mapper.match()
• wadi.unitconverter module
  • dict2str()
  • UnitRegexMapper
    • UnitRegexMapper.__init__()
    • UnitRegexMapper._dict2RE()
    • UnitRegexMapper.str()
  • UnitConverter
    • UnitConverter.__init__()
    • UnitConverter._get_mw()
    • UnitConverter.get_uc()
    • UnitConverter._str2pint()
• wadi.utils module
  • check_arg()
  • check_arg_list()
  • check_if_nested_list()
  • parse_name_and_units()
  • StringList
    • StringList.__init__()
    • StringList.replace_strings()
    • StringList.strip()
    • StringList.strip_parentheses()
    • StringList.tidy_strings()
  • valid_kwargs()
  • fuzzy_min_score()
  • _wadi_style_warning()